Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chaf1aQ9QWF0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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