Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mid2Q9QUS6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mid2Q9QUS6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mid2Q9QUS6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms