Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms