Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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