Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Scamp5Q9JKD3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms