Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms