Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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