Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms