Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SyncQ9EPM5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms