Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms