Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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