Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms