Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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MsraQ9D6Y7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MsraQ9D6Y7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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MsraQ9D6Y7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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MsraQ9D6Y7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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MsraQ9D6Y7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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MsraQ9D6Y7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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MsraQ9D6Y7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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MsraQ9D6Y7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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MsraQ9D6Y7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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MsraQ9D6Y7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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MsraQ9D6Y7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MsraQ9D6Y7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms