Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm3404Q9D506 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm3404Q9D506 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm3404Q9D506 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm3404Q9D506 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm3404Q9D506 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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