Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms