Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms