Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp2Q9CYZ8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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