Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms