Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cnot11Q9CWN7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cnot11Q9CWN7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cnot11Q9CWN7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cnot11Q9CWN7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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