Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sppl3Q9CUS9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sppl3Q9CUS9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sppl3Q9CUS9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sppl3Q9CUS9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sppl3Q9CUS9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sppl3Q9CUS9 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sppl3Q9CUS9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sppl3Q9CUS9 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sppl3Q9CUS9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sppl3Q9CUS9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sppl3Q9CUS9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sppl3Q9CUS9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms