Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1aQ9CU62 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms