Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rprd1bQ9CSU0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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