Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9CRC3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms