Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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