Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms