Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms