Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brms1Q99N20 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms