Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ3

Pink1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pink1Q99MQ3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pink1Q99MQ3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pink1Q99MQ3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pink1Q99MQ3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pink1Q99MQ3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pink1Q99MQ3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pink1Q99MQ3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pink1Q99MQ3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pink1Q99MQ3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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