Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms