Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Ddb2Q99J79 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Ddb2Q99J79 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Ddb2Q99J79 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Ddb2Q99J79 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Ddb2Q99J79 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Ddb2Q99J79 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Ddb2Q99J79 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ddb2Q99J79 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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