Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms