Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms