Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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