Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms