Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Bcas3Q8CCN5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bcas3Q8CCN5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bcas3Q8CCN5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Bcas3Q8CCN5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Bcas3Q8CCN5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Bcas3Q8CCN5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Bcas3Q8CCN5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bcas3Q8CCN5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bcas3Q8CCN5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Bcas3Q8CCN5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bcas3Q8CCN5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bcas3Q8CCN5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Bcas3Q8CCN5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Bcas3Q8CCN5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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