Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q8C5C9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8C5C9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8C5C9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q8C5C9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q8C5C9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q8C5C9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8C5C9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8C5C9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8C5C9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8C5C9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8C5C9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8C5C9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q8C5C9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Q8C5C9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Q8C5C9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Q8C5C9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Q8C5C9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Q8C5C9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q8C5C9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Q8C5C9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8C5C9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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