Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Smarcal1Q8BJL0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Smarcal1Q8BJL0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Smarcal1Q8BJL0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Smarcal1Q8BJL0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Smarcal1Q8BJL0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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