Protein–RNA interactions for Protein: Q80X53

Ccdc116, Coiled-coil domain-containing protein 116, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc116Q80X53 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc116Q80X53 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms