Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp397Q7TNK4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms