Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ubfd1Q78JW9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ubfd1Q78JW9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ubfd1Q78JW9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ubfd1Q78JW9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ubfd1Q78JW9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ubfd1Q78JW9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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