Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms