Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NfrkbQ6PIJ4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfrkbQ6PIJ4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms