Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
BC061212Q6P8K3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms