Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smchd1Q6P5D8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms