Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Krt40Q6IFX3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Krt40Q6IFX3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Krt40Q6IFX3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Krt40Q6IFX3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Krt40Q6IFX3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Krt40Q6IFX3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Krt40Q6IFX3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Krt40Q6IFX3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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