Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nop58Q6DFW4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nop58Q6DFW4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms