Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SnrpcQ62241 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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SnrpcQ62241 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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SnrpcQ62241 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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SnrpcQ62241 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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SnrpcQ62241 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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