Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms