Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Klf3Q60980 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms