Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms